生命科学涉及很多重要的领域，包括代谢组学、蛋白质化学、新药发现、中药研究等。传统的分析技术在生命科学研究中存在瓶颈，不能满足其对高灵敏度、高通量和高准确度的要求，尤其对于复杂生物样品的分离检测和表征。质谱学及其联用技术近年来的快速发展，成为突破生命科学研究瓶颈的支柱。本文介绍了质谱新技术在生命科学重要领域的应用，包括多维液相色谱-质谱联用、离子淌度高分辨质谱、高分辨质谱数据库、建立在质谱技术基础上的组学方案，在中药基础研究、中药代谢组学、生物制药、复杂体系的高通量表征等领域的优势。尤其建立在离子淌度质谱基础上的4D分析，对于快速表征不同复杂样品的差异化、结构异构体的分离、脂质组学和代谢组学研究有着无可比拟的优势，能够提供高灵敏度、高分辨率和高通量的流程和平台。最近发展起来的Vista-Flux代谢组学软件平台，为代谢组学研究提供更加准确和便捷的流程和生物通路分析的解决方案。色谱技术的发展是质谱在生命科学广泛应用的基石，尤其二维液相色谱极大提高了复杂体系的分离能力，与高分辨质谱联用，是生物样品表征的强有力手段。