【摘 要】
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本文简述结合生物信息学和分子生物学实验技术建立的肺炎克雷伯菌比较基因组平台及其近期研究进展。首先，广泛收集了不同来源菌株，其次，通过MobilomeFINDER策略考察了36株菌
【机 构】
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上海交通大学微生物代谢国家重点实验室生命科学技术学院
【出 处】
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第四届全国微生物基因组学学术研讨会
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本文简述结合生物信息学和分子生物学实验技术建立的肺炎克雷伯菌比较基因组平台及其近期研究进展。首先，广泛收集了不同来源菌株，其次，通过MobilomeFINDER策略考察了36株菌染色体tRNA/tmRNA基因位点的外源DNA片段插入情况，发现了多个10~150kb大小的新基因组岛及新耐药质粒。基于tRIP-PCR普查结果，筛选出一株泛耐药的碳青霉烯酶产生菌Kpneumoniae HS11286进行了全基因组测序，并建立了该临床菌的遗传操作系统。提出对肺炎克雷伯菌可移动基因组的系统性研究将帮助人们更为深入地理解细菌遗传多样性、致病机理和耐药性传播机制。
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