乌鳢、斑鳢自交系与杂交系早期发育的DNA甲基化差异分析

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为了阐明乌鳢和斑鳢杂交子代乌斑鳢(乌鳢♀×斑鳢♂)杂种优势形成的分子机制,本研究运用荧光定量PCR技术检测了乌、斑鳢自交子代及其杂交子代早期胚胎发育过程中DNA甲基转移酶基因Dnmt3a的m RNA表达谱;并利用甲基化敏感扩增多态性(MSAP)技术分析了三种鱼早期胚胎过程中基因组DNA的甲基化水平变化。结果显示:三种鱼的Dnmt3a基因m RNA从受精后12小时(12 hpf)胚胎开始表达,其表达水平并随着胚胎的发育而升高;MSAP分析发现孵化出膜仔鱼DNA甲基化水平随着其发育的进行而升高,在孵化1天(24 hpf)、2天(48 hpf)和3天(72 hpf)的仔鱼中,乌鳢仔鱼的DNA甲基化水平分别为0.2571、0.3066、0.3023,斑鳢仔鱼为0.2575、0.2986、0.3045,乌斑鳢仔鱼为0.2542、0.2843、0.2805,杂交仔鱼的DNA甲基化程度显著低于自交仔鱼。另外,本研究通过比较分析三种鱼早期胚胎发育过程中Dnmt3a的表达谱及基因组甲基化水平的变化,初步确定了Dnmt3a表达水平、鱼类早期发育基因组DNA甲基化水平与乌斑鳢杂种优势形成的关系。研究结果为进一步探讨Dnmt3a基因对鱼类早期发育过程中DNA甲基化的调控作用以及甲基化对鱼类杂种优势形成的作用奠定了前期基础。
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