小麦是世界上重要的粮食作物之一,现代品种中有限的优良等位基因位点限制了小麦分子改良的进程。为此本研究选择了163份黄淮麦区重要的小麦品种,以90K芯片表征基因型信息对13个产量相关的农艺性状进行了全基因组关联分析,挖掘到了一系列新的优良等位基因位点。农艺性状在三年、三个地点共计14个环境中调查。共检测到了1769个显著性SNP位点,其中包括已经报道的位点和新的候选遗传区域,平均解释大约20%的表型变异。在这些显著性位点中,位于染色体6AS、6AL、6BS、5BL和7AS的重复性与多效性SNP显著的与千粒重关联。部分标记如BS00021705₅1和wsnp_Ex_c32624₄1252144分别在12和13个环境中检测到,解释大约24%的表型变异。粒长显著性位点主要分布在染色体7BS、6AS、5AL、和5BL上。株高相关的显著性位点主要分布在4DS、6DL、2DS和1BL上,并且都在多于11个环境中检测到,解释将近55%的表型变异。四个SNP位点在两个RIL群体中进一步验证为重要的遗传位点。基于显著性SNP的重复性和所解释的表型变异,共有41个位点可能是调控产量相关性状的重要位点。41个位点的优良等位基因分布表明:随着时间的推移,借助分子改良,现代品种整合了更多的优良等位基因,尤其在株高和穗下节等性状中。然而,在所调查的现代品种中,仍有19个位点的优良等位基因的比例不到一半,因此在黄淮麦区产量相关性状的改良中,这些位点应格外关注。本研究为产量相关性状的遗传解析提供了重要信息,并为中国小麦的分子标记辅助选择提供了有价值的遗传位点。