毛竹液泡膜Na+/H+逆向运输蛋白基因克隆及表达分析

来源 :中国林学会竹子分会四届四次全委会暨第六届中国竹业学术大会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lblb0628wto
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植物Na+/H+逆向转运蛋白具有稳定细胞质内Na+浓度和调节pH 值的功能,对于植物的耐盐性具有重要的作用.利用RT-PCR和RACE 技术分离出毛竹Na+/H+逆向转运蛋白编码基因PeNHX1 的cDNA序列,全长共2290bp.该基因的编码蛋白PeNHX1包含545 个氨基酸残基,与芦苇PaNHX1、水稻OsNHX1的序列同源性分别为89%和88%.统发育分析表明PeNHX1蛋白与禾本科植物液泡膜Na+/H+逆向转运蛋白的亲缘关系较近,与质膜型Na+/H+逆向转运蛋白亲缘关系较远.以半定量RT-PCR 检测PeNHX1 基因的表达情况,发现PeNHX1受到200mM NaCl胁迫的诱导,在4 h 内的表达量随NaCl处理时间延长持续增强,其中根部的表达增强幅度明显高于茎和叶,但4 h后,PeNHX1在根与叶中的表达量均有所下降;推断PeNHX1基因在盐胁迫下的表达调控与毛竹耐盐能力密切相关.
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WRKY转录因子家族的成员广泛参与植物抗逆反应和多种生理代谢过程。为了研究WRKY蛋白在毛竹中的作用,本研究克隆了一个PheWRKY10基因,GenBank登录号GU944762.序列分析表明,该基因全长1080bp,包括一个579bp开放阅读框,推测编码一个由193个氨基酸组成的蛋白质。序列分析结果表明,PheWRKY10基因编码蛋白的保守元件与禾本科植物甘蔗、水稻、小麦、黑麦草等有很高的一致性
采用RT-PCR技术,从毛竹中克隆到一个编码色素蛋白的cDNA,编码区为810 bp,命名为PePsbS(GeneBank No.FJ600727).序列分析表明该基因编码的氨基酸序列与来自单子叶植物的PsbS高度同源,该基因属于色素结合蛋白基因家族。蛋白结构预测表明,该蛋白包含导肽部分和成熟蛋白,其中成熟蛋白包含4个跨膜结构域。将PePsbS基因编码成熟蛋白的序列构建到原核表达载体中,并将其转入
从绿竹(Bambusa oldhami)中克隆到cDNA片段766bp,其中包括开放阅读框ORF(Open ReadingFrame)为504bp,编码168个氨基酸,与水稻的OsYABBY1(OsYAB1)基因同源性达89%,命名为BoYABBY1(BoYAB1).通过序列分析比对表明BoYAB1基因的编码产物含有保守的zinc finger-like结构域和YABBY结构域,属于YABBY基因
根据已报道的禾本科植物PPO基因的保守序列(CuA和CuB区)设计一对引物,分别从紫竹不同栽培变型中克隆到PPO基因片段。对这些片段的序列进行了分析,9个序列彼此之间的同源性均达到92%以上,氨基酸序列分析显示,不同栽培类型间的氨基酸序列存在很大差异,在某些栽培类型(一年紫、毛金竹和沟槽紫)中,该基因存在提前终止的现象。所获得的9条序列间存在明显的SNP位点,多数位点引起非同义突变。采用Mega4
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本研究以毛竹幼苗为材料,利用RT-PCR和RACE技术分离出一个液泡膜H+-ATP酶c亚基基因(PeVHA-c)全长cDNA序列。主要存在于液泡膜和其它各种内膜系统,在植物对胁迫的响应中起极为重要作用。该基因全长为634 bp,含有一个495 bp的开放阅读框(ORF),编码含165个氨基酸残基的蛋白。PeVHA-c蛋白分子量为16.6 kDa.该蛋白与其它物种的V-H+-ATP酶c亚基的氨基酸序