【摘 要】
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水稻白叶枯病是水稻的一种重要病害,由Xanthomonas oryzae pv.oryzae (Xoo)引起.疣粒野生稻(Oryza meyeriana)是云南的一种重要稻种资源,一般认为对白叶枯病高抗免疫,人
【机 构】
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四川大学生命科学学院,成都610064
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水稻白叶枯病是水稻的一种重要病害,由Xanthomonas oryzae pv.oryzae (Xoo)引起.疣粒野生稻(Oryza meyeriana)是云南的一种重要稻种资源,一般认为对白叶枯病高抗免疫,人工接种产生过敏坏死.为了深入挖掘利用疣粒野生稻的基因资源,我们利用RNA-seq技术分析了疣粒野生稻对白叶枯病菌侵染的转录应答,旨在揭示可能参与抗病反应的基因或通路.用Xoo菌液人工接种叶片,分别0,2,4,24,48 h取样,提取RNA.然后将2和4h合并用做早期应答；24和48 h合并认作晚期应答.测序后将所有样品的reads合并组装,共获得210,313条contigs,从中筛选出编码ORF的contig 57,313条,其平均长2,637 bp,N50长3,123 bp.
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