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高通量DNA测序技术的发展带来了新一代微生物学微生物基因组学研究的热潮，迄今已有超过7万株细菌及近2千株真菌基因组被测序。在已经测序的微生物基因组中，特别是宏基因组序列中发现了大量未知的天然产物合成基因簇，这些未知的或者沉默的天然产物生物合成基因簇的数量要远远大于目前已知的天然产物的基因簇数量，这些沉默基因簇的产物将是开发新型活性化合物的宝贵资源。但是这些天然产物基因簇一般都是超过20kb的大基因片段，使用传统的DNA克隆方法克隆这些基因簇需要构建基因组文库、杂交筛选、缝合形成完整的基因簇，每个基因簇克隆需要费时费力。