森林土壤微生物是森林生态系统的主要组成部分之一,在林地凋落物分解、腐殖质合成、土壤养分循环以及能量转化中起着重要作用.而土壤微生物多样性是土壤微生物学研究中应用最广泛的指标. 森林土壤微生物多样性的研究方法一般有培养法和非培养法两种.最传统的实验方法是微生物稀释平板培养法.主要通过使用不同营养成分的固体培养基对土壤中可培养的微生物进行分离培养,根据微生物的菌落形态及其菌落数来计测微生物的数量及其类型.但是,自然界中可培养的微生物不到总数的1％ .BIOLOG 微平板法是测定土壤微生物对 95 种不同碳源的利用能力及其代谢差异,进而用以表征土壤微生物代谢功能多样性或结构多样性的一种方法.这种方法主要用来研究空间及时间尺度上微生物群落的变化.利用磷脂脂肪酸(PLFA)可以表征土壤微生物的组成.但是PLFA 法对微生物的分类还不够精确,只能根据某些相同生理特征分成一个大的类群,主要由于土壤微生物种类的多样性和微生物细胞脂肪酸结构的复杂性.1986年,Pace等最先采用核酸测序技术来研究微生物生态和进化,使人们可以通过DNA水平上的研究,探讨土壤微生物的种群结构及其与环境的关系.1993年,Muyzer首次将PCR—DGGE(变性梯度凝胶电泳)技术引入微生物生态学研究,此后,该技术便被广泛应用于森林土壤微生物多样性研究.DGGE主要用于研究群落结构的多样性,且敏感度高,但是该技术只能分离较小的片段,还易可导致自然群落中微生物数量的过多估计.每种方法有自己得优劣性,所以要根据不同研究的需要,选择最合适的研究方法. 在大多数森林土壤中,细菌数量最多,如杨树林土壤中细菌比例可达到94％以上,放线菌次之,真菌数量最少,如在桉树林土壤中最少只有0.1％.在土壤条件发生变化时土壤微生物数量和分布呈现明显的动态变化.如土壤细菌与放线菌的数量大多随着林木连载的代数增加而减少,真菌则相反；一般混交林的微生物总数最大,阔叶纯林的次之,针叶纯林的最少,可能是由于混交林中植物多样性增加,食物来源多样性以及适应各类生物聚集的有效生态位的差异造成的.土壤微生物具有明显的垂直分布规律,主要集中在 0 ＜ 土壤深度( h ) ≤ 40 cm,特别是在0—20 cm之间,而后随着土壤深度的增加,数量逐渐减少,但差异是越来越小的.在林木生长季初期,可获取的土壤养分不足,影响了微生物的分布,夏季是降雨高峰期和高温期,有利于养分的溶解,易于微生物吸收,因此,夏季土壤微生物总数处于较高水平. 在微生物多样性的研究方法和研究内容上还有很大空间,所以新的研究方法和技术的引入仍然十分必要,而且需要我们更多方面的去探讨土壤微生物多样性与土壤生态过程的关系.