论文部分内容阅读
目的：评价国内建立起来的in-house HIV-1基因型耐药检测方法的敏感性与准确性。方法：以美国FDA批准的HIV-1基因犁耐药性检测系统(ViroSeqTMv2.0，瑞士)为参比对象，与建立起的基因型耐药性检测方法(in-house)平行检测待检样本，比较二者在扩增效率、耐药突变位点检测以及耐药报告等方面的一致性。结果：已知的14850个耐药突变位点中，2种方法可同时对99.34％(14752／14850)的耐药突变位点准确检出；在对不同突变位点的检测中，2种方法对蛋白酶抑制剂耐药突变位点、逆转录酶抑制剂耐药突变位点及两类抑制剂耐药突变位点检测一致率分别为99.70％、99.01％和99.34％(Kappa值分别为10.9099、0.9521和0.9488，P值均<0.00001)；2种方法出具的两类药物的耐药结果报告一致率94.55％(Kappa=0.6374，P值<0.0001)。本研究共检测到34个ViroSeqTM数据库(ViroSeqTM software v2.7)未收录位点，其中2个突变位点对耐药的影响较大，提示in-house耐药突变位点检测方法的耐药数据库与ViroSeqTM相比具有一定优势。结论：In-house基因型耐药性检测方法与ViroSeqTM基因型耐药性检测系统在耐药突变位点检测以及评价上具有高度一致性，是一种快速准确、性价比高的HIV-1基因型耐药检测方法。