稻米直链淀粉含量作用位点qSAC3的遗传鉴定和育种应用

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【研究背景】直链淀粉含量(AC)是评价稻米品质重要指标之一,分离AC遗传作用位点是有效改良稻米食味品质的必经途径。已有研究表明水稻基因组中存在大量影响稻米AC的数量性状位点(QTL),可是除Wx外,目前绝大部分位点仍未被广泛应用于水稻育种。由于AC对环境因素、尤其是环境温度较为敏感,因此同一位点在不同环境下对AC的不同影响作用可能是大多数QTL难以被育种应用的重要原因。因此通过多环境、尤其是不同温度下的重复验证,分离获得稳定影响AC的QTL位点十分重要。【材料与方法】本研究前期以一套染色体片段替换系(CSSLs)为研究材料。该CSSLs以籼稻9311为供体亲本、以粳稻日本晴为受体亲本构建完成。本研究将CSSLs种植于4个环境:人工气候室高温环境、人工气候室常温环境、实验田正季和晚季。待种子成熟后进行稻米品质测定和遗传分析。后期通过杂交和多轮回交将研究获得的1个QTL导入优质水稻品种南粳9108(AC较低),通过品质测定选育AC适中的改良型品系。【结果与分析】以替换系和背景亲本AC之间的差值为表型,通过QTL分析,我们发现在9311基因组中可能存在1个在多种环境下均能稳定提高日本晴AC的作用位点。该位点位于水稻第3号染色体上,我们将其暂时命名为qSAC3。全基因组重测序和分子标记鉴定结果表明该位点处于6.9至8.2Mb之间;同时QTL分析结果显示qSAC3的LOD值为3.144(p<0.05),具有较高的可信度。将籼稻9311的qSAC3导入粳稻日本晴后,我们发现稻米AC在多个环境下均出现显著性升高,因此我们推测籼型qSAC3具有提高粳稻AC的作用。后期,通过杂交和高代回交将9311的qSAC3导入南粳9108,并通过分子标记辅助选择我们获得了多个含有籼型qSAC3的近等基因系。抽取其中4个系的纯合种子进行品质测定,结果表明4个近等基因系的AC均显著(p<0.01)高于受体亲本南粳9108,由此表明qSAC3在Wxmq背景下也可提高稻米AC。另外,我们发现将qSAC3导入南粳9108后,近等基因系的外观品质也有所改善,稻米的透光性显著提高,暗胚乳表型得到抑制。由于南粳9108暗胚乳表型由等位基因Wxmq的低AC所致,因此我们推测qSAC3可能是通过适当提高AC而改良稻米外观品质。【结论】水稻基因组中存在1个能在不同环境下能稳定影响稻米AC的QTL位点qSAC3,将籼稻9311的qSAC3导入粳稻日本晴或南粳9108后能显著提高稻米AC,同时籼型qSAC3可改善Wxmq所致的暗胚乳表型,因此qSAC3对于改良稻米品质具有较高的应用价值。
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