【摘 要】
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基于草甘膦在EPSP合酶的作用靶点对zinc数据库进行药物筛选以得到和覃甘膦作用相似的化合物.首先利用草甘膦的理化性质对zinc数据库进行初步筛选，再利用LeadIT2.1.8进行第一次筛选，再通过SeeSAR3.2、autodock4.2.6 (Vina)进行分子对接，达到交叉验证的效果，以得到结合最优的化合物.本文的蛋白来源于PDB序列号为2GGA的晶体结构，利用结合在其中的草甘膦对目前的分子
【机 构】
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华南农业大学,天然农药与化学生物学教育部重点实验室,广东,广州510642
【出 处】
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第二届生物农药理论探索及产业化技术创新研讨会
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基于草甘膦在EPSP合酶的作用靶点对zinc数据库进行药物筛选以得到和覃甘膦作用相似的化合物.首先利用草甘膦的理化性质对zinc数据库进行初步筛选，再利用LeadIT2.1.8进行第一次筛选，再通过SeeSAR3.2、autodock4.2.6 (Vina)进行分子对接，达到交叉验证的效果，以得到结合最优的化合物.本文的蛋白来源于PDB序列号为2GGA的晶体结构，利用结合在其中的草甘膦对目前的分子对接位点进行定义，最终得到14个结合活性较好的化合物，并且初步解释了药物分子的作用机制.本文的工作第一次把通过计算机模拟的药物筛选运用到了除草剂上，给农药开发提供了一个新的思路.
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