代表分子生物学研究领域中新前沿的长链非编码RNA (long non-coding RNAs,lncRNAs)从表观遗传学、转录和转录后三个层次上发挥对基因表达调控的重要作用。目前已发现越来越多的lncRNAs在正常细胞生理活动中担当不可或缺的角色,并且参与多种肿瘤和其他疾病的病理发展过程。先前我们仅能够通过包括遗传印记、染色质重塑、剪切调控、mRNA降解和翻译调控在内的多种机制确定lncRNAs的功能。所以建立更多更新的技术研究lncRNAs功能显得尤其重要。探究lncRNAs的主要工具包括微阵列、RNA测序(RNA-seq)、Northern印记、实时定量逆转录聚合酶链式反应(qRT-PCR),荧光原位杂交(FISH)、RNA干扰(RNAi)、RNA-结合蛋白质免疫沉淀(RIP)、通过RNA纯化进行染色质分离(ChIRP)、交联免疫沉淀(CLIP)和生物信息学预测。我们着重对lncRNA的功能以及研究lncRNA-蛋白质相互作用的先进方法进行综述。