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活性污泥作为废水处理系统的功能主体，以悬浮填充、附着生长或生物菌膜等方式存在于生化反应器中，并对废水中的污染物基质进行生物降解。其中微生物群落的生理活性直接影响系统的功能稳定和污染物降解效能，了解和预测这些多样的微生物群体在特定生境中的功能特征或对环境胁迫的应激表现，是优化废水处理系统的生物降解进程的关键。利用RNA-Seq高通量测序技术在环境转录组水平上进行活性污泥微生物的生理活性研究，回避了微生物分离培养的技术瓶颈，从生物群体的视角探索功能基因与环境之间的互作关系，实现了原位解析微生物群落组成及复杂多样的代谢功能，不但可以发掘、鉴定新的功能基因，还对污染物生物降解的机理解析和进程调控提供有力的理论支持。