猪圆环病毒Ⅱ型四川株的全基因克隆及序列分析

来源 :第二届中国畜牧科技论坛 | 被引量 : 0次 | 上传用户:robert_xt
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本试验通过从可疑病料中直接提取DNA为模板,参照Genbank中参考序列设计一对特异性引物,一次反应扩增获得长约1800bp的目的片段,克隆入pMD18-T获得阳性重组质粒,经酶切鉴定和序列测定结果表明该质粒含有长1767bp的PCV-2全基因组,将其命名为pMD18-T-PCV-2-SC。通过BLAST与GenBank中来自美洲、欧洲及中国的部分PCV-2毒株进行同源性比较分析,结果毒株间的同源性介于93.6%~98.6%。该结果表明我们所采病料中含有PCV-2病毒,将该毒株命名为PCV-2-SC株。将其主要ORF与其他PCV2毒株进行了比较,结果PCV2-SC株的ORF1与16个毒株的ORF1之间同源性为94.7%~99.4%;ORF2的同源性则为90.3%~99.6%。
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