台湾西南海域的水文环境呈现明显的季节差异，经常受到降雨、高屏溪口陆源水、黑潮支流、南海表层水以及潮汐流之交互影响，因此水文状态较为复杂，而生存于此海域的浮游动物群聚分布亦受到这些环境因子交互之影响，加上各物种习性的不同，而有着较不规律之分布模式。由2013年8月及12月及2014年4月于台湾西南海域采集浮游动物分析结果，我们针对浮游桡足类及翼足类，分别鉴定出15科25属96种及4科11属19种，相较于邻近海域的研究结果物种算是十分多样化。浮游桡足类及翼足类的丰度和物种数大多有明显的季节及空间变化，但不同物种分布模式略有不同，以三季采样调查结果来看，桡足类和翼足类均以春季(4月)的丰度和种类数较高。此外，我们也发现这些浮游动物物种分布与水文因子相关性不显着或不1致，桡足类与翼足类由于食性相似，在生态上属于食物竞争的关系，因此两者的丰度常常会有互相消长的情形，且部分桡足类与翼足类之丰度分布亦明显受到海水温度和盐度之影响。以长期观察结果来看，台湾西南近岸海域浮游动物之群聚分布呈现明显的年度间及季节性差异，我们认为这可能是受到陆源水及季节性水温或水团变化之交互影响。