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对猪源脑心肌炎病毒(EMCV)GXLC株进行全基冈组克隆、测序和分析。采用RT-PCR技术分段扩增基因组开放阅读框(ORF)，应用3’-RACE和5’-RACE技术扩增3’-UTR和5’-UTR，分别对扩增片段进行克隆和测序，经拼接后获得GXLC株全基因组序列，共7 725个核苷酸。与NCBIGenBank上登录的国内外参考毒株进行同源性比较及系统进化分析结果表明，GXLC株与GX0601、GX0602、BJc3、HB1等国内分离株以及CBNU、K3、K11、BEL-2887A、EMCV-R、PV21等国外分离株同源性达99％以上：基于全基因组、结构蛋白及非结构蛋白基因序列绘制的系统进化树拓扑结构图相近，所有EMCV分离株可分成两个群：Ⅰ群和Ⅱ群，Ⅰ群可细分为Ⅰa亚群和Ⅰb亚群，其中猪源EMCV属于Ⅰa或Ⅰb亚群、鼠源EWCV属于Ⅰa亚群、野猪源EMCV属于Ⅱ群，GXLC株与其它中国分离株均属于Ⅰa亚群。