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大部分新生儿出生于一个无菌环境.预防新生儿院内感染的最主要目的是早期新生儿肠道正常菌群定植.1,预防MRSA感染的关键方法：1)生后尽早和母亲皮肤接触并鼓励母乳喂养；2)母婴同室并让母亲怀抱婴儿；3)生后即刻母亲的照顾和母乳喂养可以促进新生儿肠道双歧杆菌的生长；4)接触新生儿前后和为孩子洗澡前后都应用酒精洗刷手(澡盆在每次用后都应该消毒)；5)所有的器械都应该个体化和消毒(体温计,听诊器等应该个体化),同时所有暖箱使用后常规消毒；6)如有院内MRSA感染,应筛查工作人员和患儿,并外用莫匹罗星.2,极低出生体重儿双歧杆菌肠道定植和对肠道感染的作用以及双歧杆菌的生长：一项91例,5例为一组的前瞻性对照临床试验被完成,所有孩子随访至6岁.生后2周时肠道定植率为73％,但在对照组定植率仅为12％.早期使用双歧杆菌显著降低了从胃部吸入空气并能显著改善体重增长.肠道感染率显著下降.3,超低出生体重儿早期诊断和预防肠道真菌感染的治疗方法：39例孕周小于27周的早产儿发生肠道的真菌感染,对其行回顾性调查.肠道真菌感染的诊断依靠粪便中分离出孢子和菌丝.一旦在任何标本中检测到真菌,就应立即经胃管预防性给予两性霉素B或Myconazole.我们调查超低出生体重儿肠道真菌感染的临床表现发现：喂养不耐受(8/12),高血糖(8/12),血小板减少(9/12),α-酸性糖蛋白升高(12/12)而无CRP增高(2/12).不予以口服抗真菌治疗发现高病死率如66.7％ (8/12),肠道给药治疗肠道真菌感染包括预防性治疗可以降低病死率至9.5％ (2/21) (P=0.0012).产道分娩而且孕周小于26周的超低出生体重儿和多胎分娩的无绒毛膜羊膜炎组织病理依据的超低出生体重儿最为高危.相反,在有组织病理依据的绒毛膜羊膜炎组(阳性组=2/21(4.7％)对阴性组=8/12(66.7％)： p=0.0012),和嗜依红血球增多组(阳性组=1/12(8.3％)对阴性组=9/21(42.9％)：p=0.0419)病死率低.肠道真菌感染应该早期诊断,并诊断为多系统真菌病的潜伏期.对于超低出生体重几可根据革兰氏染色结果尽早预防性肠道给予抗真菌药物.