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为进一步降低申嗪霉素生产成本，将应用范围扩大到主要粮食作物水稻的纹枯病防治。运用分子遗传学原理，构建了gacA和qscR两个全局性负调控基因的双突变菌株M1SGQ，对发酵条件建数模优化，发酵单位达到4.5g/l以上，提高了3倍;进一步通过剂型改造，防效提高了10倍，使申嗪霉素的生产和使用成本下降并接近井冈霉素水平。2008年，申嗪霉素1％悬浮剂经南方十省、市的示范推广试验，用量仅为井冈霉素1/10之一，对水稻纹枯病的防效基本上能达到80％以上。