Matrix factorization in bioinformatics

来源 :第二届中国计算机学会生物信息学会议 | 被引量 : 0次 | 上传用户:bigtim1
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  Nonnegative matrix factorization(NMF)is a powerful technique for dimension reduction and pattern recognition.In this talk,I will survey the recent applications of NMF and its variants joint NMF in bioinformatics.Next,I will introduce some new algorithmic exploration about joint NMF and its application in RNA-protein binding prediction.Lastly,I will present a flexible NMF framework CSMF to combine data dimension reduction and differential analysis into one paradigm to simultaneously reveal common and specific patterns from data generated under interrelated biological scenarios.
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