利用RAPD(Randomly Amplified Polymorphic DNA)技术对７个山楂种、２４个栽培品种的亲缘关系、种系演化进行了研究。筛选出２０个１０－ｍｅｒ的寡聚核苷酸引物用于ＰＣＲ反应(Polymerase Chain Reaction)，共获得了１３９个ＲＡＰＤ标记。利用ＰＡＵＰ３．１(Phylogehy AnalysisUsing Maximum Parsimony)软件对获得的数据进行处理，经过１７５６５１５７次重排，获得了最短长度为２１５个单位的最小生成树，并计算出每个种、品种之间的遗传距离。研究结果表明，在种一级的进化水平上，ＲＡＰＤ标记表现出较多的多态性，平均每个引物获得７个多态性标记，而品种（系）、类型内平均每个引物获得５个多态性标记；供试的７个种由低级向高级的进化顺序为毛山楂、陕西山楂、阿尔泰山楂、伏山楂、山楂、华中山楂、湖北山楂；在品种（系）类型中，从品种深化的角度看，大部分栽培品种起源于山楂种，但有一部分品种则可能起源于华中山楂或湖北山楂，或者是山楂、华中山楂、湖北山楂３个 之间的基因互渗或漂移的结果，因而提出了栽培山楂多元起源及种间杂交区间演化的假说。