基于组学的与对虾血蓝蛋白调控相关的信号通路研究

来源 :第十届世界华人虾蟹养殖研讨会暨2016年中国河蟹产业发展高峰论坛 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hbjxwjy
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
  本研究采用RNAi技术以及包括转录组学、蛋白组学和代谢组学在内的多组学联合分析的方法,从系统生物学的角度去全面探索血蓝蛋白在对虾体内的调控功能。结果 发现,凡纳滨对虾血蓝蛋白大、小亚基RNAi后,在转录组水平,围食膜因子、环氧化物酶、Pm4抗菌肽等52个基因表达显著上调,类粘蛋白、细胞表面糖蛋白、C-型凝集素6等118个基因表达显著下调,进一步对显著上调或下调基因进行GO和Pathway富集分析,发现这些差异基因与细胞吞噬、类固醇合成等40条免疫、代谢信号通路有关。在蛋白质水平,丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶、胰蛋白酶、围食膜因子等235个蛋白表达量显著上调,细胞因子受体蛋白、ATP合酶、细胞外调节蛋白激酶(ERK)等434个蛋白表达量显著下调,进一步通过GO和Pathway富集分析,发现这些差异蛋白主要与包括核糖体通路、丙酮酸代谢通路、溶酶体通路、弧菌感染刺激通路、Wnt等在内的273条信号通路有关,其中显著相关性信号通路19条。在代谢组水平,在正离子模式和负离子模式下分别有2610、1441个离子发生显著上调或下调,进一步通过差异代谢物通路分析,发现这些差异离子可能与类固醇激素合成通路、卟啉和叶绿素代谢和花生四烯酸代谢通路等63条信号通路有关。最后,通过三个组学发关联分析,发现对虾血蓝蛋白可能参与包括磷酸肌醇代谢通路、类固醇激素合成通路、细胞内吞通路等在内的21条信号通路的调控。所获研究结果为揭示血蓝蛋白在对虾免疫、代谢网络中的调控地位积累了丰富的资料,对阐明对虾免疫防御机制具有较大的理论意义与参考价值。
其他文献
以凡纳滨对虾(Litopenaeaus vannamei)为研究对象,通过分子筛层析、Tricine-SDS-PAGE、Western-blotting、凝集实验、抑菌实验和Edman N端测序等方法探索血蓝蛋白酶解片段的凝集和抑菌活性.结果 发现,血蓝蛋白经胰蛋白酶水解后可产生分子量约为6-70kDa的7条片段,该酶解混合物对副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)具有显著的
本研究采用DGGE、高通量测序和生物信息学技术,对以凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)Toll(LvToll1)的SNPs及其免疫相关性进行了深入的研究.结果 发现,LvToll1在DGGE和高通量测序水平存在明显的单核苷酸多态性,其中LvToll1-V3在DNA水平存在错义突变位点145个,突变频率>1%的SNPs位点3个;在cDNA水平,存在错义突变位点38个,突变频率>1
甲壳动物神经内分泌-生理功能调控已成为目前国内外研究热点问题.在甲壳动物眼柄中X-器窦腺复合体(XO-SG)在结构和功能上类似于脊椎动物的下丘脑-神经垂体系统,合成与分泌多种神经肽激素,其中高血糖激素家族(CHH)是窦腺中含量最多的一类激素,具有调节能量代谢、免疫防御和渗透调节等多种功能.本文重组表达了凡纳滨对虾的高血糖激素,通过注射实验研究高血糖激素--免疫调控机制.实验梯度设置为:对照组(对虾
为了进一步探明谷胱甘肽系统对镉引起的氧化损伤的防御作用,本实验根据背角无齿蚌(Anodonta woodiana woodiana) 96h镉的半致死浓度,设置了5个染毒组(4.22,8.43,16.86,33.72,67.45 mg·L-1)和1个对照组,处理24、48、72和96h,测定鳃与肝脏中还原型谷胱甘肽(GSH)、氧化型谷胱甘肽(GSSG)含量和谷胱甘肽硫转移酶(GST)、谷胱甘肽还原
为了比较急性、亚慢性镉胁迫对河南华溪蟹(Sinopotamon henanense)卵巢组织抗氧化酶活性,和脂质过氧化水平的影响以及探究N-乙酰半胱氨酸(N-acetylcysteine,NAC)对其氧化损伤是否有缓解作用,本实验采用急性和亚慢性镉胁迫相结合的方法.急性组设置了对照组、7.25和14.5mg/L镉浓度处理3d、5d和7d;亚慢性组设置了对照组、0.725和1.45mg/L镉浓度处理
中华锯齿米虾广泛分布于亚洲淡水水域,因其体色丰富多样,自2003年开始成为一种重要的观赏虾。但是其体色的分子遗传基础尚未知。在观赏中华锯齿米虾中,红、黄和透明3种体色品系的体色遗传最稳定。这为进行体色分子机制研究提供了良好的材料。通过比较这3种体色品系的皮肤转录组,获得了红色与透明品系2292条差异基因,黄色与透明品系6158条差异基因。在所获得差异基因中,有75条果蝇或家蚕的同源基因已被证明与体
△9去饱和酶是不饱和脂肪酸合成通路中的关键酶之一,它能催化硬脂酸合成油酸,从而增加体内不饱和脂肪酸的含量.为探究低温条件下红螯光壳螯虾△9去饱和酶基因的表达机制,本研究利用RACE-PCR技术,从红螯光壳螯虾肝胰腺中克隆获得了△9去饱和酶基因的全长序列,该序列全长1236bp,开放阅读框长1041bp,编码346个氨基酸残基, 5端UTR长116bp,3UTR长79bp,3端含PloyA尾,初步确
拟穴青蟹是我国东南沿海地区重要的海水养殖蟹类,在当地养殖经济中占有较大比重.但其雌雄个体间的生物学特征和经济性状存在显著差异,对养殖的规模化具有一定影响.本研究对拟穴青蟹的精巢和卵巢组织进行去除核糖体反向富集转录组文库构建,采用Illumina Hiseq测序平台进行测序,将组装到的Unigene进行聚类并比对到Swiss-Pro、GO和KEGG数据库中注释,开展差异表达基因和差异lncRNA的分
为探讨磷虾目的系统进化关系,以磷虾目的50种磷虾为研究对象,分析其线粒体COⅠ基因片断序列,构建系统发育树,初步探讨了种属间亲缘关系.结果 显示,COⅠ基因可比序列长度为519bp,共包含258个变异位点,全部为碱基替换,无插入/缺失位点.四种碱基含量为A27.58%、T 35.47%、G 18.88%、C 18.07%,碱基A+T(63.05%)含量高于G+C(36.95%),表现出明显的T偏倚
对虾急性肝胰腺坏死病(AHPND)被鉴定为由一株携带有特殊质粒的副溶血弧菌引起,感染该病的对虾一般表现为空肠空胃、肝胰腺萎缩发白,组织切片常表现为肝小管上皮细胞脱落,其高致死率给对虾产业带来严重的冲击,而目前为止关于AHPND发病过程中对虾体内的免疫应答机制尚不清楚.为此,本研究构建了三个对虾血细胞感染24小时的转录组文库(致病副溶血弧菌刺激、非致病副溶血弧菌刺激组、生理盐水组),通过Illumi