目的:研究新疆博州地区3-5岁蒙古族儿童变形链球菌的水平传播方式,为儿童龋病早期预防提供依据。方法:收集36名同班级3-5岁蒙古族儿童口腔中牙菌斑标本进行厌氧培养,通过细菌形态学观察、生物化学鉴定、聚合酶链反应扩增变形链球菌基因的特异性片段葡糖基转移酶B以及随机引物聚合酶链反应等方法对获得的变形链球菌临床分离株进行鉴定及扩增。结果:36例儿童中变形链球菌的检出率为88.9%,有龋组检出率96.2%,无龋组检出率70%。经革兰氏染色、生化鉴定和聚合酶链式反应得到284株鉴定为变形链球菌。在检出变形链球菌的32名儿童中通过随机引物聚合酶链反应发现66个基因型,其中8名儿童携带1种基因型,16名儿童携带2种基因型,6名儿童携带3种基因型,2名儿童携带4种基因型。其中有两种基因型在15名儿童口腔内可重复检出。结论:变形链球菌在该蒙古族班级儿童中可能存在水平传播,但基因型检出数目与龋坏严重程度关系不明显。