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非编码RNA (ncRNA)与RNA结合蛋白(RBP)结合，参与多种生物学过程的调控，并在肿瘤的发生发展中发挥重要作用。然而，绝大多数ncRNA的作用机制及其与RBP之间互作的潜在规律仍有待阐明。本研究通过整合CLIP-Seq等数据，开发新的算法clipScan和rbsScan系统地鉴定ncRNA与RBP的互作调控网络；进一步结合功能基因组数据，开发基于ncRNA-RBP互作网络预测ncRNA功能的新方法。与此同时，我们基于癌症基因组学数据鉴定肿瘤特异的ncRNA及其与RBP的互作网络，整合GWAS数据在RBP结合位点上鉴定导致肿瘤发生的SNP位点，探讨它们在肿瘤发生发展过程中的作用，扩展我们对ncRNA功能及其调控网络在肿瘤中功能的认识。