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县级进行乡镇机构改革后，检疫工作中存在的现状及其问题，只有引起足够重视，在兽医体制改革中从改革乡镇站管理体制、健全村级防疫网络，健全和完善有关的法规、规定，抓好技术培训，加强基础设施建设，完善硬件建设，强化内部监督制度，建立科学合理的奖惩机制等方面改革，才能更有效发挥检疫工作在防止禽流感等重人动物疫病中的作用。