【摘 要】
：
利用多种PCR技术从西门塔尔牛瘤胃微生物宏基因组内直接克隆出一种木聚糖酶基因Rua11A,并利用生物信息学软件对该基因序列和及其编码氨基酸序列进行预测和分析,序列分析结果表明:Rua11A全长1278bp,包括762bp的木聚糖酶编码区、102bp的连接肽编码区和411bp的碳水化合物结合域编码区,共编码425个氨基酸.Rua11A的氨基酸序列中包含31个氨基酸的信号肽及394个氨基酸的成熟肽;其
【机 构】
：
扬州大学,动物科学与技术学院,江苏扬州,225000 云南草地动物研究院,云南昆明,650000
【出 处】
：
中国畜牧兽医学会养牛学分会第八届全国会员代表大会暨2015年学术研讨会
论文部分内容阅读
利用多种PCR技术从西门塔尔牛瘤胃微生物宏基因组内直接克隆出一种木聚糖酶基因Rua11A,并利用生物信息学软件对该基因序列和及其编码氨基酸序列进行预测和分析,序列分析结果表明:Rua11A全长1278bp,包括762bp的木聚糖酶编码区、102bp的连接肽编码区和411bp的碳水化合物结合域编码区,共编码425个氨基酸.Rua11A的氨基酸序列中包含31个氨基酸的信号肽及394个氨基酸的成熟肽;其成熟肽的理论分子量和等电点分别是43443.9Da和4.25;序列比对分析显示,Rua11A含有11家族木聚糖酶高度保守的氨基酸片段及催化活性中心,且与瘤胃中两种已知的11家族木聚糖酶的同源性分别为78％和56％;其木聚糖酶预测的空间结构具有11家族木聚糖酶的典型特征,即由2个β-折叠片和1个短的α-螺旋组成的“右手”型结构,表明Rua11A木聚糖酶属于11家族木聚糖酶.比对结果还显示Rua11A中的底物结合域隶属于碳水化合物结合域第四家族.
其他文献
高海拔地区的寒冷、缺氧条件会影响动物胚胎的生长发育.鸟类的胚胎在体外发育,对环境变化尤为敏感,孵化率随着海拔升高而降低.低氧环境会造成鸡胚胎发育速度减慢、孵化时间延长、孵化率下降.本研究分别采用常压低氧、低压低氧测定不同品种鸡种蛋的胚胎死亡、器官发育和孵化率等表型指标,并采用高通量测序技术测定鸡胚胎心脏转录组,筛选与低氧适应表型相关的基因和调控通路,为进一步探讨鸡胚胎低氧适应的分子机制提供基础.
本研究通过上述各项指标的测定,比较地方品种鸡(北京油鸡)和白来航种公鸡繁殖后期的繁殖力,为合理评价地方鸡种用价值进而提出改良措施提供依据.睾丸是精子发生的场所，睾丸状态对公鸡精液品质和繁殖力作用巨大。公鸡35周龄以后睾丸重量自然萎缩，精液产量随之下降，受精率也受到一定影响。本研究结果显示，北京油鸡后期体重、睾丸重和性腺指数显著高于白来航公鸡。睾丸各项测定参数较高，其中约翰逊评分显著高于白来航公鸡。
本研究选取了9对鸡荧光标记微卫星引物分析淮南麻黄鸡和霍邱鸡遗传多样性,为安徽大别山区地方鸡种的选育开发提供参考.本研究采用荧光标记微卫星引物和高通量基因组扫描技术可以快速准确地鉴定每个个体的基因型，具有很高的分辨率和灵敏度，较早期采用的聚丙烯酰胺电泳加银染的方法更加准确和高效，可以真实的反映2个地方鸡种的遗传多样性。所选9个微卫星标记等位基因数最少的4个，最多的达到了13个，PIC最低的标记为MC
豆粕是优质的植物性蛋白质饲料,其氨基酸含量丰富、组成合理,但含有多种抗营养因子,降低了动物对豆粕的消化率,将豆粕进行发酵处理,可以消除或钝化抗营养因子的不利影响,促进其在牛生产中的应用.
Marbling is an important trait regarding the quality of beef.Analysis of beef cattle transcriptome and its expression profile data are essential to extend the genetic information resources and would s
本研究克隆了牛HGF基因的蛋白质编码区全长，并对其CDS(Coding Region Sequence)区序列和编码蛋白的氨基酸序列进行生物信息学分析，为后续在牛上开展HGF基因的功能研究奠定基础。本试验获得了牛HGF基因的CDS区，并成功构建T-HGF质粒。利用生物信息学手段分析发现，预测的牛HGF蛋白结构域与已有报道的其它物种HGF蛋白结构一致，说明HGF蛋白高度保守，在其它物种上研究的HGF
为从泌乳曲线角度量化不同胎次和产犊季节的差异,本研究利用DHI记录和Wood模型,拟合分析北京地区代表性牛场的荷斯坦奶牛泌乳曲线,并对泌乳曲线参数进行分析.结果表明,Wood模型拟合群体泌乳曲线R2变化范围为0.9489～0.9769,且受到胎次的极显著影响.达到产奶高峰的速度和高峰后下降速度分别只受到胎次和产犊季节的极显著影响(P＜0.01);高峰泌乳月和泌乳持续力都同时受到胎次的极显著影响(P
本研究首次对中国荷斯坦牛乳腺组织进行lncRNA研究，以期望鉴定到新的lncRNA为奶牛分子育种提供新的思路，寻找新的突破点。本研究鉴定到的781个lncRNA很大比例来自于基因间的lncRNA（lincRNA），与Shancheng Ren等人报道的相符。鉴定到的lncRNA有553个lncRNA属于新的lncRNA，这些新的lncRNA可以更好的补充NONCODE数据库。对lncRNA的统计分
采用DNA测序技术对65头FLW牛THRSP基因内含子进行SNPs多态性检测.发现THRSP内含子存在6个SNP位点,分别为A790C、A724G、T682C、T470C、T448C和G378A,其中A790C含有AA、AB、BB三种基因型,其余5个位点含有AA、AB两种基因型.方差分析结果表明,T682C和T448C两处碱基突变对牛肉大理石花纹性状存在影响.
本研究采用了现阶段研究较为成熟同时也最适合畜禽育种的基于生物学通路的全基因关联分析运用于西门塔尔肉牛育种中，以期发现影响肉牛肉质性状的通路。本研究针对目前基于通路的全基因组关联分析的算法的缺陷，提出了一种新的基于通路的关联分析算法并将西门塔尔肉牛的GWAS数据进行了分析，在263条通路中发现了γ-氨基丁酸通路和非酒精性脂肪肝通路分别于宰前活重和眼肌面积显著两个重要的肉质性状相关。γ-氨基丁酸通路已