科研团队是实现科学研究、技术推广与生产实际紧密结合的重要科研活动单元.学术界已就科研团队性质、作用、创新效果及管理开展了多方位研究,然而在测度科研团队层面协同创新绩效的相关文献上较少报道,且在科研团队创新绩效测度上未能剥离外部环境因素和统计噪声的影响,因此对决策单元的创新绩效评价很难做到准确和客观,当然就规模效率状况亦无法明确认知.由此,本文在对苹果、梨、茶叶、桃等林果业国家级科研创新团队调研的基础上,借助三阶段DEA方法,尝试获得如下新信息：(1)剔除外部环境因素和统计噪声的影响,获得林果业科研团队层面各决策单元真实准确的协同创新绩效；(2)通过SFA分析过程,全面把握各环境要素对决策单元创新过程作用的方向及程度；(3)就决策单元的技术效率进行分解,明确其效率较低的决定性因素,是管理无效抑或规模无效；(4)就分析结论给出可操作的建议.通过实证分析得出以下结论：(1)在综合考虑管理无效率、环境及随机干扰等复合因素情况下,林果业科研团队样本成员的综合技术效率均值为0.3850,纯技术效率均值为0.8733,平均规模效率为0.4160.说明在林果科研团队现有的创新环境及投入水平下,科技团队成员的协同创新效率具有61.5％的上升空间,立足团队成员综合技术效率的提升无疑会提高林果业科技团队协同创新能力,从而提升现代林果业发展的科技支撑.(2)SFA回归结果显示：林果业科技团队成员职称的提高,可以明显减少在时间和合作交流方面的投入松弛量,职称对经费投入松弛的影响未通过显著性检验,仅存在方向上的影响；团队成员对团队目标的认知程度的明晰,有助于减少经费和合作交流投入松弛量,但会增加团队成员投入时间的无效性,其中,经费投入松弛量方程中t值通过1％的显著性检验,余下两个方程中t值检验不显著,仅存在方向上的影响；团队成员之间熟知程度越高,可以有效减少团队成员经费投入的松弛量,但反而却造成了团队成员时间和合作交流投入的无效性,但仅具有方向性影响；林果业科研团队之间频繁的交流可以增加团队成员经费和合作交流投入松弛量的有效性,但也造成了团队成员时间投入松弛量的无效性,也只存在方向性影响；团队经费支出合规性的提高,可以有效增加团队成员在时间和经费投入松弛量的有效性,但对团队成员合作交流松弛量具有逆向作用,但回归方程相应自变量系数的t值未通过显著性检验,仅具有方向性影响；随着地方政府对林果业科研团队的支持力度的增大,可以明显增加团队成员在经费和合作交流投入上的有效性；科研团队依托单位性质的差异对团队成员的创新绩效具有显著影响,但企业较高校和科研单位更具创新性.(3)投入变量调整前后团队协同创新绩效具有明显差异,规模效率较低是导致当前林果业科技团队成员协同创新效率较低的最主要原因.具体来看,林果业科研团队成员综合技术效率仅为0.3623,具有63.77％的提升空间,纯技术效率高达98％,表现良好,规模效率仅为0.3663,成为导致团队协同创新效率较低的主因.据此,提出可操作的建议.