基于转录组学分析技术挖掘广东虫草光调节转录因子

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光作为重要的环境因子对真菌的多种生命活动均有重要的影响,而真菌中存在多种光受体,能够感应光的诱导进而调节下游靶基因的表达,最终影响真菌的生长发育、代谢及节律等过程。广东虫草作为第二种获批新食品原料的虫草类真菌,并已被证明有多种显著的活性功效,具有重要的研究意义和经济价值。课题组前期研究发现光照对广东虫草菌丝体转色、子实体发育原基形成、子实体产量及品质等有显著影响,但光对广东虫草发育的影响机理目前还不太清楚。本研究首先分析了广东虫草中存在的光受体及其类型,然后通过转录组学技术分析了光诱导条件下广东虫草中转录因子的表达,并对光响应关键转录因子进行了系统分析及功能预测。结果显示,广东虫草基因组中至少存在1个红光受体,6个蓝光受体及1个节律蛋白;转录组分析结果表明,有170多个转录因子的表达受光的调节,其中早期光响应转录因子中有20个基因表达显著上调,31个基因表达显著下调;而晚期光响应转录因子中,30个基因表达显著上调,23个基因表达显著下调。这些基因表达显著受光诱导的转录因子主要有6类,包括C6锌指结构转录因子、C2H2类型锌指结构转录因子、其他锌指结构转录因子、bZIP转录因子、MYB转录因子、GATA转录因子等。功能预测分析结果显示,C6锌指结构转录因子中2个基因可能与子实体发育相关,7个基因可能与代谢物合成相关;而GATA转录因子中2个为蓝光受体基因,参与调节广东虫草的多种生理活动;另外2个分别参与碳代谢及含铁细胞生物合成调节。本研究结果为后期深入研究光影响广东虫草发育及代谢机理提供了重要的基础。
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