猪粪和土壤样品中微生物DNA提取方法的比较

来源 :中国畜牧兽医学会家畜生态学分会第六届理事会暨学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:chenziling
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随着规模化养猪业的迅猛发展,猪场的粪污排放量急剧增加,在一定程度上对土壤微生物多样性造成影响.为了可以选用同一种DNA提取方法研究猪粪对土壤微生物的影响,本文选用了化学裂解法和试剂盒法从土壤样品和猪粪样品中提取微生物的总DNA,并对这两种方法提取DNA的效果进行比较,以评价这两种方法的有效性.结果表明,试剂盒法无法用于提取土壤中的微生物DNA;可以从猪粪中提取到DNA,PCR扩增能得到目的产物,但重复性不高.化学裂解法处理土壤样品,提取的DNA浓度高但纯度低,纯化后土壤样品的DNA损失程度不同,但纯度有所增加,为后续的PCR反应提供了浓度较高的微生物DNA样品模板,PCR扩增结果重复性不高;处理猪粪样品,提取的DNA浓度较低但纯度比较高,PCR扩增结果比较理想.由此可见,化学裂解法用来提取猪粪样品中的微生物DNA是可行的,但需寻求更好的土壤样品微生物DNA提取办法.
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