代谢是生命最基本的形式。传统的代谢组学分析方法无法判断代谢物中的碳、氮或其他元素如何通过代谢通路进入其他中间代谢产物,即"从哪里来到哪里去"和代谢流速率变化情况。稳定同位素标记的代谢流分析,则有效解决这一问题。通过在细胞培养或动物喂养方式,加入稳定同位素标记的营养物,运用质谱检测带稳定同位素标记的代谢物,从而鉴定出代谢通路的切换与流量大小的变化。以碳-13标记为例,碳-13标记的葡萄糖、谷氨酰胺、乙酸等,可产生乙酰辅酶A,并为脂质合成提供碳源。我们进一步把代谢流分析技术应用于三个不同的肿瘤代谢研究项目中。发现缺氧条件下,肿瘤细胞对乙酸的摄取增加,并促进了表观遗传改变而促进脂类合成；发现转酮醇酶在肝癌细胞中可在氧化型戊糖磷酸途径与非氧化型戊糖磷酸途径之间进行切换；发现天然产物常山酮可通过抑制糖代谢从而抑制结直肠癌的生长。这些工作均采用代谢流分析方法,有助于阐明相关代谢机制。