代谢组学是后基因时代的一门新兴的独立学科.该学科的应用跨越生物技术和医药技术,具有广泛的发展前景.它与药物的药效、毒性筛选、评价研究以及安全性评价、作用机制研究和合理用药密切相关.用反应整体思想的代谢组学研究中药,对中药毒性进行科学的、综合的评价,以现代标准认识中药毒性,对于确保中药的合理、安全、有效,建立现代中药的评价体系,指导临床拟订合理的用药方案、剂量和时间均有理论意义和实用价值.提出基于代谢组学的中药现代研究的四方面的设想:一是完善基础技术平台,在样品制备分析技术的能力、速度、灵敏的综合要求,数据分析中的数据描写与处理、模式识别、建模仿真、数据库和专家系统等方面,结合化学计量学和数据描写与处理、模式识别、建模仿真、数据和专家系统等方面,结合化学计量学和生物信息学建立代谢组学研究的技术平台;二是开展中药方剂配伍的科学性研究,从代谢组学的整体观念与中药作用的整体观念的一致性的认识来看,它适用于中药复杂体系的研究,适用于解决中药难以认识的整体效应和认识药物作用的物质基础问题;三是研究中药安全性,为在今后对中药利用复方进行"减毒增效"的机制研究打下基础;四是开展中药种质资源研究,应用代谢组学技术能为中药资源的可持续发展提供科学依据,确保中药资源的数量和质量、中药材规范化.