随着分子生物学技术的迅猛发展，涌现出一批高效、可靠的DNA分子标记技术。DNA分子标记是指能够反映生物个体或种群间基因组中某种差异的特异性DNA片段，是DNA水平上遗传多态性的直接反映，是生物分类学、育种学、遗传学和物种起源与进化等研究的重要技术指标之一。本文论述了限制性片段长度多态性、随机扩增多态性、扩增片段长度多态性、微卫星DNA和单核苷酸多态性等技术的基本原理及技术特点，介绍了常用的分子遗传标记在畜禽遗传图谱的构建、数量性状座位的定位、标记辅助选择、群体遗传多样性评估、品种鉴定等研究领域的应用情况。这些分子遗传标记的发展，为畜禽遗传育种以及品种改良过程中的一系列传统技术方法所无法解决的问题，提供了新思路，开创了新途径，大大提高了育种工作效率。本文还对这些标记在峪口禽业公司蛋鸡育种中的实际应用进行分析并探讨了今后分子育种主要研究和应用前景。