每年已有数以万吨的抗生素滥用于水产养殖业，从而导致自然环境急剧恶化。然而，某些常见的水产类病原菌在抗生素胁迫下的分子生物学行为机制仍存在许多未知之处。本研究通过运用结合iTRAQ和SWATH-MS两种蛋白质组学定量标记——质谱分析方法对不同浓度的盐酸土霉素处理下嗜水气单胞菌进行蛋白质水平的鉴定分析。结果表明，在土霉素胁迫下许多参与蛋白质合成和翻译的相关蛋白表达量有所增加，而参与代谢途径等相关的蛋白表达量却相对减少。此外，通过利用高通量、高效性的Scheduled high-resolution multiple reaction monitoring (sMRMHR)质谱检测以及qPCR技术对11种待鉴定蛋白做进一步的质谱验证。研究表明，该水产类病原菌极有可能是通过下调某些参与新陈代谢途径的蛋白表达以及上调参与其翻译相关的蛋白，从而来应对生境中的抗生素胁迫并产生细菌耐药性。