随着大数据时代的到来,基因组选择作为一种取代传统动物育种工作的新兴育种技术,引起全世界动物育种界的广泛关注.相对于奶牛基因组选择,由于我国奶牛DHI报告的实施以及中国荷斯坦青年公牛联合后裔测定规程的发布,奶牛表型数据的采集快捷而方便,而进行肉牛基因组选择,采集表型数据是一项复杂而耗资巨大的工作.本文利用一步法对模拟数据集缺失个体进行基因组育种值估计研究，以期对我国肉牛基因组选择技术平台的推广提供软件支持。对于不同群体规模，在同一QTL数目情况下，随着遗传力的增加，育种值估计的准确性升高。而随着QTL数目增加，个体表型数据的缺失，不会对基因组育种值估计的准确性造成影响，也就是利用一步法估计基因组育种值，其准确性不下将，反而升高。相对于GBLUP模型，用基因组SNPs信息估计个体间的亲缘关系矩阵代入混合线性模型直接计算无表型个体的基因组育种值，不仅提高了计算效率，基因组育种值估计的准确度下降在一定范围内。当群体规模较大时，利用一步法可以有效提高个体表型缺失的基因组育种值估计的准确性。