德氏乳杆菌保加利亚亚种遗传多样性和种群结构的MLST分析

来源 :第七届全国微生物资源学术暨国际微生物系统与分类学研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:Tender
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  德氏乳杆菌(Lactobacillus delbrueckii)是乳杆菌属中最重要的一个种,德氏乳杆菌保加利亚亚种(L.delbrueckii spp.bulgaricus)、德氏亚种(spp.delbrueckii)、乳酸亚种(spp.lactis)以及相继发现的印度亚种(spp.indicus)、L.delbrueckii spp.sunkii和L.delbrueckii spp.jakobsenii,共同构成了德氏乳杆菌目前的六个亚种.其中,保加利亚亚种由于其优良的发酵特性和益生功能,被广泛用作商业化生产的酸奶及奶酪的发酵剂.然而目前,我国基于该菌种的基础研究还很少,对其种群结构的研究更是寥寥无几.为了更好地了解L.delbrueckii spp.bulgaricus的进化和系统发育关系,本研究采用较成熟的多位点序列分型(Multi-locus Sequence Typing,MLST)技术对分离自不同国家(中国123株,蒙古国118株,俄罗斯44株,其他国家13株)的发酵乳制品中的298株德氏乳杆菌进行遗传多样性和种群结构的分析研究.首先,选取clpX、dnaA、murE、groEL、pyrG、recA、rpoB等7个看家基因构建MLST方案,鉴定得到251株德氏乳杆菌保加利亚亚种菌株.通过Bionumeric 6.0软件包和eBURST v3.0分析,这些分离株被进一步区分为106个序列型,5个克隆复合体,相较于整个德氏乳杆菌种,其显示出较低的遗传多样性.同时采用Structulre和Splitstree软件分析其种群结构,结果显示,保加利亚亚种分离株中可检测到明显的同源重组现象,但依然可以将所有分离株识别为6个不同的克隆谱系,且不同分离地的菌株有着其独特的基因型,说明分离自不同生境的德氏乳杆菌菌株有着不同的进化历程,尤其是分离自商业发酵剂中的菌株聚类于一个独立谱系,这将有助于新型发酵剂菌株的开发筛选.
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