【摘 要】
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目的:探索甘草通过抑制环氧酶-2(COX-2)发挥抗炎作用的分子基础.
方法:运用Discovery Studio4.5系统预测化合物的分子性质,运用Ligand Profiler筛选与COX-2药效团作用的
【出 处】
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第九届国际分子模拟与信息技术应用学术会议(ICMS&I2018)
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目的:探索甘草通过抑制环氧酶-2(COX-2)发挥抗炎作用的分子基础.
方法:运用Discovery Studio4.5系统预测化合物的分子性质,运用Ligand Profiler筛选与COX-2药效团作用的甘草天然成分;运用AutoDock Vina1.1.2软件进行甘草天然成分与COX-2蛋白的分子对接.
结果:甘草中的芳香族在分子量、分子表面积和分子溶解度这三方面与非甾体类抗炎药物(NSAIDs)最为接近,其次是黄酮,萜类/皂苷类则相差最大,而脂肪族类波动较大;将513个甘草小分子与59个COX-2药效团进行模拟结合,筛选出了118个小分子(FitValue＞0.5);用这118个甘草成分(A组)与40个NSAIDs(B组)与COX-2蛋白(1CVU)对接后发现,COX-2蛋白与甘草中的黄酮类和芳香族的结合能较低,而与脂肪族和萜类的结合能较高;结合分子量、分子表面积、分子溶解度的预测值,最终筛选出结合能低的、对COX-2酶具有潜在抑制作用的42个甘草天然成分,包括35个甘草黄酮成分和7个芳香族成分,其中有2个黄酮成分已被实验证实对COX-2酶具有选择性抑制作用.
结论:采用药效团初筛、分子对接再筛、结合小分子的理化性质精筛的三步曲方案,可以从中药天然成分中筛选出已知靶标(如COX-2酶)的潜在抑制剂.
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