结直肠癌是一种常见的恶性肿瘤,与生活习惯和遗传等因素相关。本研究项目名为"利用NGS技术对结直肠癌患者癌症及正常组织的转录组比对研究",属于基础领域研究。下一代测序技术(NGS),又称作高通量测序技术,通过DNA或RNA提取、纯化、建库、生物信息学分析等实验操作,全面获取细胞与组织的总RNA与转录组RNA,检测肿瘤基因的变异与异常表达,提供较为准确的治疗靶点。本实验通过NGS技术比较五位结直肠癌患者的五对肿瘤组织样本中正常组织(n:normal)与肿瘤组织(t:tumor)的转录组:从中提取总RNA用于m RNA建库,通过基于NGS转录组测序技术(RNA-seq)与生物信息学分析收集与导致结直肠癌的转录组信息,作为临床研究与治疗的指导。来自结直肠癌患者的转录组信息的RNA-seq数据反映了结直肠癌/正常组织对的比较中不同的表达模式;两个显著的靶点COL1A1和SPP1,与其他两个以前的研究一致,其中一个研究里富集的通路也与我的研究一致。