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本文在考虑房屋基础隔震体系刚度分布特点的基础上，将上下部结构刚度比作为摄动参数，系统建立了非比例阻尼下隔震结构动力特性计算的摄动迭代方法。理论推导及算例说明，该方法实现了上部结构和隔震层阻尼比的有效分离和各变量之间的耦合。计算过程简捷、稳定、收敛快，计算结果准确。同时通过算例，比较了本文方法和比例阻尼方法，分析了基础阻尼和上部结构阻尼对隔震结构动力反应的影响。