【摘 要】
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Many Cymbidium species possess important commercial value worldwide for their exotic ornamental flowers.Due to big market demand, the over-collection and habitat destruction of natural Cymbidium speci
【机 构】
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Zhejiang Provincial Key Laboratory for Genetic Improvement and Quality Control of Medicinal Plants,
【出 处】
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2016首届中国中药资源大会暨CSNR中药及天然药物资源研究专业委员会第十二届学术年会
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Many Cymbidium species possess important commercial value worldwide for their exotic ornamental flowers.Due to big market demand, the over-collection and habitat destruction of natural Cymbidium species has led to these plants being currently under severe threat of extinction.However, the identification of Cymbidium species is very difficult because of their similar shapes, which hinders their safe utilization and resource conservation.In the present study, firstly, we investigated four plastid loci (matK, rbcL, psbA-trnH and atpF-atpH) and a nuclear locus (ITS) from 18 Cymbidium species to develop an efficient DNA barcode for the identification of Cymbidium species in China.Our results showed that all these DNA regions, except atpF-atpH, can be amplified easily from Cymbidium and sequenced with established primers.Our research also demonstrated that ITS have the most intra-and inter-specific divergences, greater barcoding gap and the highest species discrimination rate (93.2%) among the single locus.Among the combinations of loci investigated (ITS+ matK, ITS+ psbA-trnH, ITS+ matK+ psbA-trnH and matK+ rbcL), ITS+psbA-trnH performed best but its species resolution rate (93.2%) is only equal with ITS alone.Secondly, we used ITS as DNA marker to infer phylogenetic relationships of 29 species of genus Cymbidium.The results showed that cluster analysis using the ITS barcode mainly supported the relationship between the species of Cymbidium established by traditional morphological methods.To sum up, ITS region can not only be used as an efficient barcode to identify Cymbidium species, but also has the potential to contribute to the phylogenetic analysis of genus Cymbidium.
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