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随着加速器和探测器性能的提高，高能物理实验将面临海量数据实时处理和系统高可靠性的挑战。本文所描述的以ATCA为架构，基于FPGA实现的高性能计算节点系统将成为解决难题的可能途径。单个计算节点有5个Virtex4 FX60 FPGA，4个千兆以太网和8个基于RocketIO实现的高速串行光纤通道提供数据传输途径，单个计算节点数据吞吐量达90Gbps。在一个机箱内，14个计算节点通过机箱背板的高速线相互连接，组成一个计算节点小系统，把若干个小系统连接起来，就可以构造一个高性能计算节点系统，完成数据组装、数据筛选、算法实现以及触发判选等功能。这个系统将应用到未来的高能物理实验当中。