【摘 要】
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罗伊氏乳杆菌(Lactobacillus reuteri,L.reuteri)是一种革兰氏阳性的专性异型发酵菌,可广泛定植于人和动物等脊椎动物的肠道中.曾有研究表明分离自老鼠、猪和人类肠道的L
【机 构】
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内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室,呼和浩特010018
【出 处】
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中国微生物学会第六届全国微生物基因组学学术研讨会
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罗伊氏乳杆菌(Lactobacillus reuteri,L.reuteri)是一种革兰氏阳性的专性异型发酵菌,可广泛定植于人和动物等脊椎动物的肠道中.曾有研究表明分离自老鼠、猪和人类肠道的L.reuteri在不同宿主的驱动下分别经历着不同的进化历程.为了探究L.reuteri的适应性进化机制,本研究对16株分离自牛(n=4)、山羊(n=5)、绵羊(n=4)、马(n=3)的罗伊氏乳杆菌进行了全基因组测序,结合已完成全基因组序列测定并公布于NCBI数据库中的21株菌,进行了比较基因组学分析.结果 显示,经过同源序列比对,37株L.reuteri可构建出一个含有725个基因的核心基因集(core-gene family)和一个含有8668个基因的泛基因集(pan-gene family).同时,以模式株DSM20016T为参考序列进行变异分析,37株菌共具有92270个单核苷酸多态性位点(SNPs).
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