塑料微芯片电泳正逐渐成为蛋白质快速分析的一种重要方法,但是蛋白质的非特异吸附及压力流动会使峰展宽,利用未经处理的聚合物微芯片分析蛋白质很难得到好的分离效率和重复性,通常需要对微通道表面进行改性或加入添加剂来增强蛋白质与固定相的相互作用[1],调控蛋白质的迁移行为,从而提高分析效率.壳聚糖具有很好的生物相容性,且在不同条件下具有不同的粘度和自组装状态[2].本工作中,通过接触角测定、流动电势测量、原子力显微镜等方法考察了壳聚糖对环烯烃共聚物(COC)表面的改性作用及其对蛋白质的抑制作用.并有效利用电泳中产生的焦耳热和壳聚糖(CS)与β-甘油磷酸酯(GP)的温度响应性质,30s即可在COC芯片微通道中形成整体柱.考察了电压及壳聚糖浓度对整体柱微观形态分布的影响，结果表明，壳聚糖浓度越大，构成整体柱微观结构越密集。为了便于比较，通过加热的方法模拟整体柱的形成，比较了不同温度下CS/GP体系的微观形态，发现37℃时壳聚糖呈微粒状，温度降至20℃时微粒分散，部分溶解，0℃时均匀分散。并且比较了不同温度制备的整体柱的亲疏水性分布，发现随温度降低，疏水区域减少。将制备的芯片整体柱用于绿色荧光蛋白三种亚型的分离，有效分离距离为1cm时，30s内即可成功分离，理论塔板数可以达到1.7×106/m。