盐生植物是指在NaCl浓度超过200 mM的环境中可以生存并完成生活史的植物。内生真菌与盐生植物在高盐的极端环境下形成共生,具有高度的物种多样性,并且可提高宿主植物对逆境胁迫的抗性。本研究在中国沿海不同维度选取四个地点,对共计7科27种盐生植物的内生真菌群落用非培养方法进行研究。对高通量测序结果进行标准化后,结果表明,从227份样品中总共鉴定出1154个OTU,其中797个为子囊菌,314个为担子菌,5个为结合菌,3个为壶菌,35个为未鉴定真菌。Botryosphaeria dothidea是研究中多度最高的OTU,而Cladosporium cladosporioides分布最为广泛,所有地点和宿主中都出现。不同盐生植物的内生真菌的多样性和群落结构都有显著差异,其中宿主对群落的影响比地点高。宿主偏好性结果显示,375个内生真菌OTU表现出了显著的宿主偏好性。网络分析结果表明,盐生植物内生真菌网络具有显著的低连接度、高特异性、高模块性、高嵌套性的特征,并且真菌显示出对植物较强的竞争关系。