来源于丁香假单胞菌的高氯酸可溶蛋白和葡萄糖的复合物晶体结构

来源 :第三届中国结构生物学学术讨论会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhangshun102
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  丁香假单胞菌西红柿变种DC3000的高氯酸可溶蛋白(perchloric acid-soluble protein,PSPTO-PSP)根据序列同源度分析,属于YjgF/YER057c/UK114家族,此家族中人源和鼠源的L-PSP蛋白具备核糖核酸内切酶活性,参与调控细胞的基础生理过程.它们的四级结构表面有三个深的长而窄的沟,据报道此深沟可以结合不同的配体.我们首次发现PSPTO-PSP蛋白可以结合葡萄糖,并且报道结合有葡萄糖的分辨率为2.1(A)的来源于丁香假单胞菌的PSPTO-PSP蛋白的复合物晶体结构,它采用同家族蛋白的四级结构模式——三聚体,葡萄糖结合于两个单体之间的深沟中.葡萄糖的结合似乎并没有改变PSPTO-PSP的四级结构构象,通过比较Yj gF/YER057c/UK 114家族蛋白和不同配体的配位形式,我们发现Arg103是配体结合的必须氨基酸,而且我们观察到葡萄糖结合的区域有足够大的空间容纳一个三联体的核酸密码子.因此我们探讨了此区域是PSPTO-PSP的核糖核酸酶活性位点的可能性,以及葡萄糖可能作为一个细胞胁迫因子,通过占据这个中心而影响PSPTO-PSP蛋白的功能.
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