【摘 要】
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基于第二代转录组测序技术,对采集自河南省新郑市的粗柄羊肚菌（Morchella crassipes）M10菌株进行了深度转录组测序,分析了全转录组简单重复序列SSR（simple sequence repeat）分布
【机 构】
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郑州轻工业学院食品与生物工程学院,华中农业大学应用真菌研究所
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基于第二代转录组测序技术,对采集自河南省新郑市的粗柄羊肚菌（Morchella crassipes）M10菌株进行了深度转录组测序,分析了全转录组简单重复序列SSR（simple sequence repeat）分布和序列特征.结果表明：1）总计检测到13 044个SSR位点,分布在8851条Trinity genes中,SSR在转录组序列中的平均密度为2067.77 bp/个,远高于其他真菌,其中2858条Trinity genes中包含超过1个SSR位点,复合型SSR位点1925个.2）单碱基重复基元
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