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目的：通过对A省17个地市的流感大流行防控卫生资源配置情况进行公平性分析，为合理配置流感大流行防控卫生资源提供依据。方法：采用普查的方法调查A省疾病预防控制系统流感大流行应对能力，运用描述性分析和Gini系数计算对公共卫生资源配置的公平性按照人口分布和地域分布进行分析。结果：疾病预防控制中心的在岗人员分布公平性较好，但是不同地区人力资源学历结构差异较大，以A1、A2的中高学历人员比例较高，消毒物资储备公平性较好。按照人口分布，防护用品包括戴帽连体防护服、医用防护口罩、16层棉纱口罩、医用手套Gini系数分别为0.5534，0.4048，0.4546，0.4445，均高于0.4的警戒水平，且N95口罩的Gini系数高达0.6952。按照地理面积分布，N95口罩、护目镜、防护面罩、戴帽连体防护服、16层棉纱口罩、医用手套的分布也呈不公平状态。结论：A省17个地级市中，以经济条件较好的A1、A2、A3的卫生资源配置较好，而经济起飞城市A16、A13、A17等相对较差。当地政府可通过制定公平卫生政策和科学测算卫生需求以提高公共卫生资源配置的公平性。