【摘 要】
:
我们对294个HIV整合酶抑制剂进行定量构效关系(QSAR)研究并建立了QSAR模型,分析了影响抑制剂活性的关键结构特征.计算一系列能够反映化合物结构的理论描述符,通过逐步回归(stepwise)算法筛选出8个重要的描述符.基于这8种重要的描述符,我们应用多元线性回归方法(MLR)建立了QSAR模型,并对模型进行了内部验证(包括相关系数R2、交互验证相关系数Q2、均方根误差RMSE)和外部验证(包
【机 构】
:
南开大学药学院,天津 300071;天津国际生物医药联合研究院高通量药物筛选中心,天津 300457
【出 处】
:
中国生物工程学会2014年学术年会暨全国生物技术大会
论文部分内容阅读
我们对294个HIV整合酶抑制剂进行定量构效关系(QSAR)研究并建立了QSAR模型,分析了影响抑制剂活性的关键结构特征.计算一系列能够反映化合物结构的理论描述符,通过逐步回归(stepwise)算法筛选出8个重要的描述符.基于这8种重要的描述符,我们应用多元线性回归方法(MLR)建立了QSAR模型,并对模型进行了内部验证(包括相关系数R2、交互验证相关系数Q2、均方根误差RMSE)和外部验证(包括R2pred和RMSE).结果表明:QSAR模型中训练集的Q2为0.743,R2为0.764,RMSE为0.499,测试集的Rpred2为0.774,RMSE为0.524.结果显示模型具有良好的鲁棒性、拟合能力和预测能力.该模型可用于设计新的高活性的HIV整合酶抑制剂.
其他文献
对温州地区4种石斛人工栽培种的形态特征、抗寒性、折干率、多糖含量、总蛋白质含量及粗纤维含量进行比较分析,以确定适合温州地区种植的石斛品种.结果显示,铁皮石斛多糖含量最高,达11.83%;折干率也最高,达22.63%;抗寒性好,在温州地区可露天越冬;且铁皮石斛市场售价高,总体来说最适宜在温州地区大面积推广栽培.齿瓣石斛虽然抗寒性也较好,但是折干率和多糖含量不高,经济价值比铁皮石斛略低.兜唇石斛和杯鞘
目的 探讨碱性成纤维细胞生长因子(bFGF)基因修饰的神经干细胞(NSCs)在治疗脊髓损伤(SCI)中的神经修复作用.方法 建立SD大鼠T9段轻度挫伤模型.损伤7天后,将hrGFP基因修饰神经干细胞(hrGFP-C17.2)和bFGF基因修饰神经干细胞(bFGF-C17.2)分别通过立体定位仪定位注入脊髓损伤中央区.
目的:糖尿病心肌病(DCM)是糖尿病的严重并发症之一,是目前糖尿病病人易发心衰和死亡的主要原因。然而,迄今为止临床上尚缺乏有效的治疗方法。研究表明,碱性成纤维细胞生长因子(bFGF)具有促进血管新生、抗氧化应激损伤及神经保护等活性,是一种有效的糖尿病心肌病的防治药物。
BldD (SACE_2077),a key developmental regulator in actinomycetes,is the first identified transcriptional factor in Saccharopolyspora erythraeapositively regulating erythromycin production and morpholog
The full-length genome consisting of three double stranded RNA (dsRNA) segments designated as dsR1,dsR2 and dsR3 respectively from a Gammapartitivirus infecting Botryosphaeria dothidea YDJ-08 strain(B
Researches on bioconversion of lignocellulosic materials for biofuel production have attracted great attention all over the world due to both the abundance of cheap and renewable cellulosic biomass an
为了探索不同样品前处理方法对于不同类型病毒检测的效果,我们分别将携带乙肝(双链环状DNA病毒)、丙肝(单正链RNA病毒)、TTV(单链环状DNA病毒)这三种不同病毒的血清等比例混合,模拟混合感染,然后分别采用MDA扩增(多重置换扩增)和随机锚定PCR扩增并进行高通量测序,同时以原始样品(未扩增)直接高通量测序作为对照。测序结果显示,MDA扩增方法适合扩增环状病毒,随机锚定PCR扩增适合含量高的病毒
Protein phosphorylation is one of the most important and essential post-translational modifications (PTMs).It plays a crucial role in regulating the decision processes and dynamic behaviors in cells s
目的:构建人睾丸特异性乳酸脱氢酶LDHC基因真核表达载体,并建立其稳定转染的HeLa细胞系。方法:采用PCR技术从人睾丸λTripEx cDNA文库中钓取LDHC序列,连接插入至pCMV-C-EGFP真核表达载体并对重组质粒进行酶切及测序鉴定;阳离子聚合物介导重组质粒转染HeLa细胞后,用G418抗生素筛选稳定转染细胞系;荧光显微镜观察稳转细胞系中LDHC-EGFP融合蛋白的表达分布,RT-PCR
丁二酸由于可以作为许多通用化学品和可生物降解的聚合物的基础材料而受到广泛关注.目前主要利用矿物燃料通过化学合成方法生产丁二酸,这种方法的环境成本很高,尤其是CO2的排放量很大.在矿物燃料的价格猛涨和环境意识增强的情况下,用生物法合成丁二酸会变得更加经济和可行.近年来,谷氨酸棒杆菌在生物法制备丁二酸领域受到关注,谷氨酸棒杆菌会在厌氧状态下停止生长,积累有机酸,如丁二酸.目前大多研究用谷氨酸棒杆菌产丁