目的建立一种新型的生物芯片样品制备方法——纳米磁珠法。纳米磁珠（Fe₃O₄）在全血中快速富集有核细胞后直接进行PCR扩增、杂交,并初步分析和探讨纳米磁珠对PCR扩增体系的影响。方法以HLA-APCR扩增体系和HLA-A小阵列检测芯片为平台,分析磁珠快速分离全血中有核细胞的实验条件的建立,探讨缓冲液PH值、Mg^2-浓度、Taq酶量、扩增产物片段长度等对磁珠-模板PCR扩增体系的影响。另外,还将磁珠分别以BSA和全血封闭后置于其它扩增体系,分析封闭后的磁珠对PCR扩增体系的影响。结果用pH 值为9.2的PBS缓冲液洗脱红细胞有助于纳米磁珠对有核细胞的吸附作用:Mg²⁺浓度的改变无助于改善PCR扩增体系中磁珠的抑制作用:增加Taq酶量有助于减轻磁珠对PCR扩增的抑制作用;磁珠对长片段的扩增抑制明显强于较短片段;封闭后的磁珠对PCR扩增的抑制作用明显减弱。结论纳米磁珠可以成功应用于生物芯片中的样品制备,为生物芯片检测全自动化、芯片实验室的建立提供一种非常有应用前景的方法。