靶向G-四链体的抗肿瘤药物智能在线筛选及评价平台

来源 :2012年中国药学大会暨第十二届中国药师周 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lyh198300
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  目的:G-四链体是富含鸟嘌呤的DNA 单链通过碱基间氢键,与自身或其他链上的鸟嘌呤形成的特殊四链DNA 结构.可形成G-四链体的基因序列在人体内基因组中普遍存在,其形成、解离以及结构间的转变与肿瘤内基因的表达以及凋亡密切相关.由于G-四链体结构及功能活性能够被小分子配体有效调控,从而下调癌基因表达以及诱导肿瘤细胞凋亡,因此靶向G-四链体的小分子化合物为新型抗肿瘤药物发现提供了一个新途径.方法:本研究团队在靶向G-四链体的抗肿瘤配体分子机理领域开展大量深入系统研究的基础上,结合已知G-四链体配体综合信息,构建了国际首个靶向G-四链体的药物智能在线研究系统技术平台——G4LDB(网络在线地址:www.g4ldb.org).结果:本平台涵盖了超过800 个已知G-四链体配体分子详细信息以及3000 余项G-四链体配体生物活性记录,是目前最为完整的G-四链体配体及生物活性记录系统.平台支持多种组合检索以及信息筛选功能,能够快速准确的定位目标配体的结构与功能.与此同时,平台提供了一个简便、高效的配体在线设计及在线评价模块,可有效实现G-四链体配体快速虚拟在线设计.结论:G4LDB 的建立实现了将G四链体配的结构、配体与G-四链体相互作用模式、实验测定技术以及G-四链体配体的生理功能等综合信息进行深度、系统的标准化及数字化,为全面、系统的研究G-四链体配体与G-四链体相互作用本质及生理功能提供强大的数据支撑.同时,其将G-四链体配体虚拟筛选及活性预测方法在线化,建立G-四链体配体在线设计、在线筛选、在线预测系统,可简便、高效地实现新型G-四链体配体分子结构设计、大规模虚拟筛选以及活性预测.G4LDB 的建立,为有效提升靶向G-四链体的新型抗肿瘤药物筛选及设计提供了一个有力的新工具.
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