茶蚕颗粒体病毒Vp39基因片段的序列分析

来源 :2007年安徽现代农业博士科技论坛 | 被引量 : 0次 | 上传用户:snrgw91924
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为了研究茶蚕颗粒体病毒基因组的组成和进化分类,我们克隆了茶蚕颗粒体病毒基因组中的一个片段。测序结果表明该片段大小为3441碱基对。序列比对分析表明该片段包含有2个完整的开放阅读框,分别为Vp39基因,ODV-EC27 (occlusionderived virus-ec27)基因;2个测序不完整的开放阅读框,它们分别对应晚期表达因子-4(late expression factor-4,lef-4)的N端序列,和CpGV ORF99同源物的C-端序列。根据Vp39和ODV-EC27的氨基酸序列进行的系统进化分析表明,茶蚕颗粒体病毒与卷蛾科宿主昆虫中分离获得的颗粒体病毒亲源关系更近。所测定的4个基因的排列顺序、转录起始方向以及重复序列的位置与其他的颗粒体病毒一致,表明它们的保守性。
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