【摘 要】
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本实验选取云南省施甸县地方鸡种作为实验对象,采用对线粒体DNA细胞色素氧化酶(COⅠ)基因进行特异扩增测序及与GenBank已有序列联配分析的方法对其进行分析.以特异性引物对其
【机 构】
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南京农业大学动物科技学院,南京210095
【出 处】
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中国畜牧兽医学会信息技术分会2013年学术研讨会
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本实验选取云南省施甸县地方鸡种作为实验对象,采用对线粒体DNA细胞色素氧化酶(COⅠ)基因进行特异扩增测序及与GenBank已有序列联配分析的方法对其进行分析.以特异性引物对其进行PCR扩增,产物经纯化后测序.从起始密码开始,分析了长651bp的序列,其中A+T含量为51.6％, C+G含量为48.4％,嘌呤平均含量与嘧啶平均含量相等.计算遗传距离,发现所有样品遗传距离在0.000-0.005之间,种内平均值为0.003.基于K2P模型构建的NJ树进行系统发育分析发现,测定样品鸡种个体与红色原鸡爪哇亚种、红色原鸡海南亚种、红色原鸡滇南亚种、泰国红色原鸡和缅甸红色原鸡等聚在一起后再与腾冲雪鸡、尼西鸡等聚为一大类;老挝本地鸡种,白洛克鸡,白来航鸡等形成一大类;灰胸竹鸡、棕胸竹鸡聚为一类;绿尾虹雉、环颈雉鸡、白颈长尾雉鸡、丛冢雉鸡自成一类,其中丛冢雉鸡为外群.
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